Las líneas de investigación tienen por propósitos desarrollar nuevos conocimientos y propuestas de solución a los problemas de la región y del país, vinculando a esta tarea la formación de investigadores en la Escuela Profesional de Ingeniería Topográfica y Agrimensura (EPITA). Se tienen las siguientes líneas y sublíneas de investigación, aprobadas con Resolución de Consejo de Facultad N.º 019-2025-D-FCA-UNA-PUNO:
EPITA · UNA Puno